日本一簡単な医療統計を目指すblog

筆者の覚書のためにできるだけ簡単に統計が使えるようになることを目指すブログです。そういう意味では細かい統計事項には触れませんし、統計家がかいているわけではありませんので間違いもあると思います。

目次

統計ソフトに関して 統計ソフトは何を使う? Rをダウンロードしよう EasyRをダウンロードする エクセル統計を使う 2X2の統計 カイ二乗?Fisher正確テスト? Rで実際にFisher正確テスト Rで実際にカイ二乗検定 Kaplan Meierを描いてみた

エクセル統計

わかりやすさという面では エクセル統計も候補に上がってくる。 easystats.hatenablog.com

Rで実際にカイ二乗検定

こんどはRでカイ二乗検定してみます。 160cm以上 160cm未満 男性 30 8 女性 24 12 データはすべてのカラムで6以上なのでカイ二乗が適応できます(以下参照)。 easystats.hatenablog.com Rを立ち上げると以下のようなマークが出てくると思います。 > 細か…

Rで実際にFisher正確テストを試してみる。

さて、前回のデータを実際にRで統計処理してみます。 Rを立ち上げると以下のようなマークが出てくると思います。 > 細かいことはともかくとして、ここに以下のように打ち込んでみます。 >fisher.test(rbind(c(30,4),c(24,12))) そうすると結果が出てきます…

統計ソフトは何を使う?

医療用の統計ソフトはいろいろとあるがどれが良いのか? 思いつくだけでもいくつも種類がある。 JMP R EasyR SPSS エクセル統計 PRISM もし、施設でJMPやSPSS、PRISMが利用できれば比較的使いやすいだろう。しかし自分で購入するとなるとかなり効果だ。 この…

Rをダウンロードしよう

Rも世界中で使用されている統計ソフトだ。 最大のメリットは無料であること。 そしてグラフなどのカスタマイズができることもメリットである。 しかし、ある程度のコーディング(プログラミング)ができないと使いこなしにくい面もある。 以下からダウンロー…

EasyRをダウンロードする

EasyRはRをベースにしたプログラムだが、その名の通り簡単に使えるのが最大のメリットだ。 ほとんど他の統計ソフトと同様なインターフェースで簡単に使用できる。 EASY Rの使い方は開発した本人の解説書がわかりやすくて良い。 以下のサイトから無料でダウン…

2X2の表の統計ーFisherまたはカイ2乗

2X2の表の統計は以下の2つだ。 Fisher正確検定 カイ二乗検定(χはエックスではなくカイと読む) 例えば男性と女性で160cm以上の人と160cm未満の人の割合が次のような場合の統計はどうすれば良いか? 160cm以上 160cm未満 男性 30 4 女性 24 12 2X2表の1…

KAPLAN MEIER とにかく実際に描いてみる1

前回はデータの準備の方法でした。 今回は実際に描いてみたいと思います。 仮にデータを以下のように用意します。 Case No Months from surgery Event 1 5 0 2 12 1 3 14 0 4 14 1 5 24 1 6 30 0 7 60 0 1人目は経過5ヶ月で生存中 2人目は経過12ヶ月で死亡…

KAPLAN MEIERを描いてみる1 データをエクセルに

KAPLAN MEIERをプロットする際にどんなデータが必要かを解説します。 例えば肺がん患者さんの手術後の生存率をプロットする場合 を例にエクセルでデータを収集してみます。 手術日 最終生存確認日または死亡確認日 イベント(この場合は死亡)ーー0(生存ま…