1 カプランマイヤーの元データをCSVでデータ保存 2 Rのディレクトリーの設定 3 以下をコピペしてRに打ち込めばとりあえずはKMカーブが完成。 前回は上から下に階段状に落ちるKaplan-Meier曲線 1 カプランマイヤーの元データをCSVでデータ保存 デスクトップに…
Kaplan-Meier曲線を描いてLog-rank testで評価 Log-rank testのためのデータをExcelで集める エクセルでカプランマイヤーを実際に描く エクセル統計のカプランマイヤーカーブ、ログランクテストの実際のサンプル画面 Kaplan-Meier曲線を描いてLog-rank test…
1 カプランマイヤーの元データをCSVでデータ保存 2 Rのディレクトリーの設定 3 以下をコピペしてRに打ち込めばとりあえずはKMカーブが完成。 1 カプランマイヤーの元データをCSVでデータ保存 デスクトップにエクセルを使ってCSVでデータを保存します。 デー…
はじめにー論文の文献に関して リファレンスの形式の整え方 Endnoteで有名な雑誌の文献リストを選ぶ Endnoteで新たにスタイルを作成する Endnoteで他のスタイルを選び、変更する Endnoteエンドノートで本文の文献サイテーションの形式を整える Endnoteエンド…
はじめにー論文の文献に関して なぜ文献が重要か? Endnoteエンドノートで文献リストを簡単に作成する方法 Endnoteエンドノートでワードに最も簡単に文献をひもづける方法 ワードで英文論文に文献リストを作成する。 はじめにー論文の文献に関して 英文論文…
Cox regressionで多変量解析 Kaplan-Meier曲線を描くのに必要な用語(復習) イベントEvent (生死) 期間 打ち切り Kaplan-Meierカーブのためのデータをエクセルで集める Cox regression testのためのデータをExcelで集める Cox regressionで多変量解析 Cox …
エクセルで打ち切り・イベントを逆に入力してしまった、、、 前回はKaplan-Meierのデータの集め方を説明しました。 Kaplan-Meier曲線を描いてみたら、、、 エクセルで簡単に0を1、1を0にする方法 エクセルで打ち切り・イベントを逆に入力してしまった、、、 …
Kaplan-Meier曲線を描いてLog-rank testで評価 Kaplan-Meier曲線を描くのに必要な用語 イベントEvent (生死) 期間 打ち切り Kaplan-Meierのためのデータをエクセルで集める Log-rank testのためのデータをExcelで集める Kaplan-Meier曲線を描いてLog-rank t…
Kaplan-Meire曲線を描いてみたいと思います。 本日はPart1データ収集です。 Kaplan-Meier カプランマイヤー曲線に必要なデータを集める イベント(カプランマイヤー曲線) Kaplan-Meire曲線を描いてみたいと思います。 本日はPart1データ収集です。 使用する…
新型コロナウィルスが猛威を振るい、多くの方がお困りの状況と察します。 早く、自体が収束することを願うばかりです。 さて、医学英語にはいろいろな略語があります。今回はPCRです。 PCRはポリメラーゼ連鎖反応 Polymerase (ポリメレース) Chain Reactio…
統計ソフトに関して 統計ソフトは何を使う? Rをダウンロードしよう EasyRをダウンロードする エクセル統計を使う 2X2の統計 カイ二乗?Fisher正確テスト? Rで実際にFisher正確テスト Rで実際にカイ二乗検定 Kaplan Meierを描いてみた
エクセル統計 統計ソフトはいろいろあってどれがいいか迷うところです。 エクセル統計 わかりやすさという面ではエクセル統計も人気である。 エクセルにプラグインするので、エクセルに入力しボタンを押せば、グラフができあがる。ただし、入力方法はある程…
Rで実際にカイ二乗検定をしてみる 簡単にカイ二乗検定を行いたい人はコチラ Rで実際にカイ二乗検定をしてみる こんどはRでカイ二乗検定してみます。 160cm以上 160cm未満 男性 30 8 女性 24 12 データはすべてのカラムで6以上なのでカイ二乗が適応できます…
さて、前回のデータを実際にRで統計処理してみます。 Rを立ち上げると以下のようなマークが出てくると思います。 > 細かいことはともかくとして、ここに以下のように打ち込んでみます。 >fisher.test(rbind(c(30,4),c(24,12))) そうすると結果が出てきます…
医療用の統計ソフトはいろいろとあるがどれが良いのか? 思いつくだけでもいくつも種類がある。 JMP R EasyR SPSS エクセル統計 PRISM もし、施設でJMPやSPSS、PRISMが利用できれば比較的使いやすいだろう。しかし自分で購入するとなるとかなり効果だ。 この…
Rも世界中で使用されている統計ソフトだ。 最大のメリットは無料であること。 そしてグラフなどのカスタマイズができることもメリットである。 しかし、ある程度のコーディング(プログラミング)ができないと使いこなしにくい面もある。 以下からダウンロー…
EasyRはRをベースにしたプログラムだが、その名の通り簡単に使えるのが最大のメリットだ。 ほとんど他の統計ソフトと同様なインターフェースで簡単に使用できる。 EASY Rの使い方は開発した本人の解説書がわかりやすくて良い。 以下のサイトから無料でダウン…
2X2の表の統計 どのようなときにFisherフィッシャー正確検定を用いるか 2X2の表の統計 2X2の表の統計は以下の2つだ。 Fisher正確検定 カイ二乗検定(χはエックスではなくカイと読む) どのようなときにFisherフィッシャー正確検定を用いるか 例えば男性と女…
前回はデータの準備の方法でした。 今回は実際に描いてみたいと思います。 仮にデータを以下のように用意します。 Case No Months from surgery Event 1 5 0 2 12 1 3 14 0 4 14 1 5 24 1 6 30 0 7 60 0 1人目は経過5ヶ月で生存中 2人目は経過12ヶ月で死亡…
Kaplan Meierに必要なデータ 簡単にKaplanMeierカーブを作成 Kaplan Meierに必要なデータ KAPLAN MEIERをプロットする際にどんなデータが必要かを解説します。 例えば肺がん患者さんの手術後の生存率をプロットする場合 を例にエクセルでデータを収集してみ…